ВНИИКР разработал праймерную систему для идентификации вируса мозаики люцерны

Вирус мозаики люцерны Alfalfa Mosaic Virus (AMV), единственный представитель рода Alfamovirus семейства Bromoviridae, является фитопатогеном, способным наносить ущерб урожаю и снижать качество сои.

AMV распространяется различными видами тлей, механическим заражением соком, прививкой, семенами, пыльцой и через зараженные инструменты. Совместное заражение AMV с вирусом мозаики сои Soybean mosaic virus (SMV), одним из наиболее распространенных вирусов сои, приводит к серьезным последствиям, таким как значительное замедление роста, хлороз, мозаичная пятнистость и деформация листьев.

Одним из способов предотвращения распространения вирусных инфекций является использование сертифицированных семян, свободных от вирусов. Для быстрой и точной диагностики применяют молекулярно-генетический метод — полимеразную цепную реакцию (ПЦР).

Специалисты Всероссийского центра карантина растений (ФГБУ «ВНИИКР» Россельхознадзора) изучили генетические особенности вируса мозаики люцерны и разработали праймерную систему для его быстрой и точной диагностики.

Особенности генома вируса, влияющие на его диагностику

Геном AMV состоит из 3-х одноцепочечных РНК положительной полярности, 3′-концы которых содержат 145 нуклеотидов, гомологичных белку оболочки, и могут принимать 2 различные конформации. Эти конформации содержат несколько шпилек, разделенных AUGC-повторами, что может затруднять амплификацию.

В связи с этим для обнаружения вируса мозаики люцерны к выбранному участку генома, расположенному в сегменте РНК 1 и входящему в состав метилтрансферазоподобного домена, разработаны праймеры и зонд, которые были проверены на отсутствие димеров и шпилечных структур.

Специфичность праймеров была подтверждена путем использования генетического материала вируса мозаики люцерны, а также других вирусов, поражающих сою.

Разработанная праймерная система позволяет эффективно идентифицировать все изоляты вируса мозаики люцерны в подкарантинной продукции.

Источник: Емельянова А. А. Диагностика вируса мозаики люцерны методом ПЦР в реальном времени. Фитосанитария. Карантин растений. 2024;(2S): 37.